・まず、各ボスが弱いこと。
・必ず冒険に行かなくてはいけないこと。
・カウンター機能で回避モンスターが弱体化したこと。
・解凍ができない。
・テンポが遅い。
・対戦はカウンター合戦。
・エンディングがフリーズしやすいこと。

カウンターが一番困りました。
丈夫さモンスターも強化したいのはやまやまですが、やりすぎだと思います。
４はストーリー面を重視していたみたいですが、そのストーリーも駄目かな、と。
伝えたいことが在り来たり。オリジナリティがない。
ゆっくりプレイしていても、１０年以内でクリア可能です。
良いところは
・複数育成機能。
・モンスターと触れ合えること。
くらいしかありません。

正直、今更買おうと思っている人は悪いところを承知で気にしないようにしないと、すぐに飽きます。

ハード性能に依ったグラフィックやシステムの
向上は見受けられるのですが、如何せん、
全体としてのバランスが悪くなっているような。
育成難易度が落ちてる、といえばビギナー指向かもしれませんが
これまでのシリーズをやり込んだユーザーなら
多分、物足りない感じが強かったのではないでしょうか。

登場キャラの個性化、ストーリー性の導入は悪くないですが
なんか中途半端です。（某トレガジ職人とか、自己紹介すらねえし）
女の子キャラへの拘りは感じられますが（笑）
せっかく、ゲームの世界観としてMFは面白いのですから
それを一際立ち上げたのなら、きっちり作り込んでほしかったです。

それとも、初回版だけなのかわかりませんが、
エンディングや円盤石関連にあったバグからして、
制作期間に追われていたのでしょうか。
４の問題点を改善して、是非とも５に活かしてほしいですね。

また再生から生まれるモンスターは
ほぼ、どのモンスターも同じの確率で出てくるので

わくわく感がかなり損なわれました。
またＰＳ２版モンスターファームのように
レアモンが出る可能性も皆無で、再生がさらにつまらないものとなっています。
（スタートボタンでカットできないのも面倒）
個人的に、再生シーンは初代モンスターファームのほうがよかった気も。

またモンスターの外見も、少々遺憾な点があります。

過去のモンスターファームに比べ、奇異な風貌のものが多く
正統派、格好良いモンスターが激減しています。（もちろんいないわけではありませんが）

複数育成などのシステムや、店の店員と仲良くなると、いいことがあるというのは◎

冒険システムと再生を改善し、本来のモンスターファームの姿に戻すことが必要だと思います。

モンスターファームが好きだ！または少々面倒なほうがやりがいがある、と思われる人向けのゲームです。
僕自身は、前者の理由で結構楽しめました。